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Total: 1 prophage regions have been identified, of which 0 regions are intact, 0 regions are incomplete, and 1 regions are questionable.
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| Region | 1 |
| Region Length | 48.2Kb |
| Completeness(score) | questionable(90) |
| Specific Keyword | integrase,terminase,portal,protease,capsid,tail |
| Region Position | 778268-826558 |
| # tRNA | 1 |
| # Total Proteins | 13 |
| # Phage Hit Proteins | 13 |
| # Hypothetical Proteins | 0 |
| Phage + Hypothetical Protein % | 100% |
| # Bacterial Proteins | 0 |
| Attachment Site | yes |
| # Phage Species | 10 |
| Most Common Phage Name(hit genes count) | PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865(4) PHAGE_Paenib_Harrison_NC_028746(2) PHAGE_Entero_SANTOR1_NC_031051(2) PHAGE_Bacter_Diva_NC_028788(2) PHAGE_Paenib_Vegas_NC_028767(2) PHAGE_Paenib_HB10c2_NC_028758(2) PHAGE_Lister_B025_NC_009812(2) PHAGE_Bacter_Rani_NC_029084(2) PHAGE_Strept_TP_J34_NC_020197(2) PHAGE_Paenib_Fern_NC_028851(1) PHAGE_Lactoc_lato_NC_004746(1) PHAGE_Strept_Sfi21_NC_000872(1) PHAGE_Lactob_JCL1032_NC_019456(1) PHAGE_Staphy_Ipla35_NC_011612(1) PHAGE_Strept_315.1_NC_004584(1) PHAGE_Strept_phiARI0131_1_NC_031901(1) PHAGE_Bacill_phBC6A51_NC_004820(1) PHAGE_Lactoc_98201_NC_031064(1) PHAGE_Strept_phiARI0460_1_NC_031913(1) PHAGE_Leucon_Ln_8_NC_027377(1) PHAGE_Strept_315.2_NC_004585(1) PHAGE_Bacter_Sitara_NC_028854(1) PHAGE_Entero_IME_EFm5_NC_028826(1) PHAGE_Lactob_LF1_NC_019486(1) PHAGE_Bacill_PfEFR_5_NC_031055(1) PHAGE_Lactoc_bIL286_NC_002667(1) PHAGE_Entero_IME_EFm1_NC_024356(1) PHAGE_Lactoc_BK5_T_NC_002796(1) PHAGE_Lactob_PLE2_NC_031036(1) PHAGE_Staphy_6ec_NC_024355(1) PHAGE_Strept_PH15_NC_010945(1) PHAGE_Strept_A25_NC_028697(1) PHAGE_Entero_vB_IME196_NC_028990(1) PHAGE_Lactob_LBR48_NC_027990(1) PHAGE_Staphy_Ipla5_NC_018281(1) PHAGE_Lister_B054_NC_009813(1) PHAGE_Lister_LP_101_NC_024387(1) PHAGE_Lactoc_bIL309_NC_002668(1) PHAGE_Leucon_phiLN25_NC_024386(1) PHAGE_Staphy_vB_SepS_SEP9_NC_023582(1) PHAGE_Strept_P9_NC_009819(1) PHAGE_Paenib_Xenia_NC_028837(1) PHAGE_Lister_P40_NC_011308(1) PHAGE_Lactob_phiJB_NC_022775(1) PHAGE_Strept_315.6_NC_004589(1) PHAGE_Strept_phiARI0468_2_NC_031923(1) |
| First Most Common Phage # | 4 |
| First Most Common Phage % | 30.76% |
| GC % | 32.00% |
| Region: | The number assigned to the region. |
| Region Length: | The length of the sequence of that region (in bp). |
| Completeness: | A prediction of whether the region contains a intact or incomplete prophage based on the above criteria. |
| Specific Keyword: | The specific phage-related keyword(s) found in protein name(s) in the region. |
| Region Position: | The start and end positions of the region on the bacterial chromosome. |
| # tRNA: | The number of tRNA genes present in the region. |
| # Total Proteins: | The number of ORFs present in the region. |
| # Phage Hit Proteins: | The number of proteins in the region with matches in the phage protein database. |
| # Hypothetical Proteins: | The number of hypothetical proteins in the region without a match in the database. |
| Phage + Hypothetical Protein %: | The combined percentage of phage proteins and hypothetical proteins in the region. |
| # Bacterial Proteins: | The number of proteins in the region with matches in the nrfilt database. |
| Attachment Site: | The putative phage attachment site. |
| # Phage Species: | The number of different phages that have similar proteins to those in the region. |
| Most Common Phage: | The phage(s) with the highest number of proteins most similar to those in the region. |
| First Most Common Phage #: | The highest number of proteins in a phage most similar to those in the region. |
| First Most Common Phage %: | The percentage of proteins in # Phage Hit Proteins that are most similar to the Most Common Phage proteins. |
| GC %: | The percentage of GC nucleotides of the region. |
Questionable (score 70-90)
Incomplete (score < 70)
| Region: | The number assigned to the region. |
| Region Length: | The length of the sequence of that region (in bp). |
| Completeness: | A prediction of whether the region contains a intact or incomplete prophage based on the above criteria. |
| Score: | The score of the region based on the above criteria. |
| # Total Proteins: | The number of ORFs present in the region. |
| Region Position: | The start and end positions of the region on the bacterial chromosome. |
| Most Common Phage: | The phage(s) with the highest number of proteins most similar to those in the region. |
| GC %: | The percentage of GC nucleotides of the region. |
Criteria for scoring prophage regions (as intact, questionable, or incomplete):
Method 1:
- If the number of certain phage organism in this table is more than or equal to 100% of the total number of CDS of the region, the region is marked with total score 150. If less than 100%, method 2 and 3 will be used.
- If the number of certain phage organism in this table is more than 50% of the total number of CDS of the region, that phage organism is considered as the major potential phage for that region; the percentage of the total number of that phage organism in this table in the total number of proteins of the region is calculated and then multipled by 100; the percentage of the length of that phage organism in this table in the length of the region is calculated and then multipled by 50 (phage head's encapsulation capability is considered).
- If any of the specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin') are present, the score will be increased by 10 for each keyword found.
- If the size of the region is greater than 30 Kb, the score will be increased by 10.
- If there are at least 40 proteins in the region, the score will be increased by 10.
- If all of the phage-related proteins and hypothetical proteins constitute more than 70% of the total number of proteins in the region, the score will be increased by 10.
If the region's total score is less than 70, it is marked as incomplete; if between 70 to 90, it is marked as questionable; if greater than 90, it is marked as intact.
gi|00000000|ref|CP002034.1| Lactobacillus salivarius CECT 5713, complete genome. 1828169, gc%: 32.90%
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Hits against Bacterial Database or GenBank File
Region 1, total 16 CDS
| # | CDS Position | BLAST Hit | E-Value | Sequence |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 778268..778290 | attL | 0.0 | Showinfo_outline |
| 2 | 791347..793056 | PHAGE_Lactob_PLE2_NC_031036: hypothetical protein; HN6_00650; phage(gi100041) | 5.47e-14 | Showinfo_outline |
| 3 | 793725..795422 | PHAGE_Entero_IME_EFm5_NC_028826: DNA polymerase; HN6_00651; phage(gi971746927) | 1.79e-73 | Showinfo_outline |
| 4 | 795423..796454 | PHAGE_Lister_P40_NC_011308: gp32; HN6_00652; phage(gi207270806) | 1.30e-08 | Showinfo_outline |
| 5 | 796458..797327 | PHAGE_Strept_A25_NC_028697: DNA primase; HN6_00653; phage(gi966201380) | 5.65e-31 | Showinfo_outline |
| 6 | 797852..797922 | tRNA | 0.0 | Showinfo_outline |
| 7 | 798185..798796 | PHAGE_Bacill_phBC6A51_NC_004820: hypothetical protein; HN6_00655; phage(gi31415769) | 9.87e-29 | Showinfo_outline |
| 8 | 798798..799745 | PHAGE_Lactoc_bIL309_NC_002668: integrase; HN6_00656; phage(gi13095806) | 1.50e-39 | Showinfo_outline |
| 9 | 800157..800810 | PHAGE_Staphy_Ipla35_NC_011612: putative methyltransferase; HN6_00657; phage(gi215401130) | 8.66e-61 | Showinfo_outline |
| 10 | 806811..808508 | PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865: terminase large subunit; HN6_00658; phage(gi526245012) | 0.0 | Showinfo_outline |
| 11 | 808521..809765 | PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865: portal protein; HN6_00659; phage(gi526245013) | 2.16e-129 | Showinfo_outline |
| 12 | 809746..810450 | PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865: Clp protease-like protein; HN6_00660; phage(gi526245014) | 1.20e-90 | Showinfo_outline |
| 13 | 810447..811577 | PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865: major capsid protein; HN6_00661; phage(gi526245015) | 2.99e-109 | Showinfo_outline |
| 14 | 813237..813887 | PHAGE_Lister_LP_101_NC_024387: major tail protein; HN6_00662; phage(gi658607821) | 3.36e-23 | Showinfo_outline |
| 15 | 814462..818286 | PHAGE_Lactob_LBR48_NC_027990: putative tail protein; HN6_00663; phage(gi937456768) | 8.86e-95 | Showinfo_outline |
| 16 | 826558..826580 | attR | 0.0 | Showinfo_outline |
>778268..778290
ATAAAAAGGAGAGTACAGGATTT
>791347..793056
LactobacillussalivariusCECT5713MQLSYSRVSTFERNPLEYKLRYLEKLDTLPDFEPTDPLILGTAMHELIQKNQNAIQQYYMSYPLINDKHIEEAIKLELLSKKVLDLLPEYGFYEVTLSNQDYIGFIDMLVKNDDGTFDIYDFKYSNSIDNYMKSAQLHLYKYYFEQTGRKVKHLRYVFIPKIRLKQKKTESEYQFRQRLKRAINKDYQIKIKDVEYNPNKVIEWLTAAKHMSEATEFPLNEDDPFWKYSPYRDYVEKGLTYNMVTLPENKRRILTEVTRRKLWIYGAPFTGKTTFANEFPDPLMLNTDGNTSYVDAPVVPIKDEVTTTGRRTSRKFAWQVFKEYIDELEKKDNDFKTIVVDLVEDLYESCRLYMYDKLGIEHESDDPFKAWDEVRTEFLSTMRRVTNLDYENIVLISHEDSTKDILSRAGAKLTTFKPNIQEKVANKIAGMVDLVCRVVVEDNEHILSFKTTTTQFGGGRLSDLSVDSINLNYDELVDVYNTSLVDTNKPKKRKQTKIEDVDEEETQKAEIEDTEEKSKEEKPKTRKRKKREEPVEDPDVEKSAEDTEEKPKEEKPRRRRRRTRQVEED
>793725..795422
LactobacillussalivariusCECT5713MLIFYDYEVFKYDWLVVIKDPENKIETVIINDSEKLKKFHQEHENCIWVGYNNNHYDQWIHKSILCDINPYEISDMIINKGVPGWKASRLFRQIKMFNYDVMIRGDGGLKSLEGFMGSNIKESDVDFNIQRKLTQAEIDETIKYCRHDVEETMEVFLNRQSDFNAQLQLCKLPTQKMNLSYLSKSKAQMAGIILEARKKIYHDEFDLDFPDTLKIEKYAQVLDFYKNQENRDYSKSLKTEIAGVPHIYAWGGVHGAKPQYFGEGYFINMDVTSLYPSLMIQYGLLSRSIKDPRKFKEIYDTRVKYKHEGNPLQAPLKIVINSTYGAMKDKNNPLYDPRQANRVCIYGQLLLTDLIEKLEPYCEITQSNTDGVLVKLRSEDDFDLIDDIAWEWEKRTHLSLEFTEFKRVYQKDVNNYVMIGTDGHVKTKGAYVKKLNPLDNNLPILNTALVNYFVNNIPVEDTINDCDDLEQFQLIAKLSSKYKYLLLNGEILNERCVRAFASKKDTDGGLLKVHCVTGRPAKFPNSPEKCFIFNDNIKNVKAPEYLDKQWYIDMAKKRLKQFGVS
>795423..796454
LactobacillussalivariusCECT5713MKLYRGYVKSNEKGAIEKFKDVPDEKLRTLDNVKKFDSYGGILAEDIVMLDVDSIEDSDKLLDILDDLDYPCIARFTEHGVHFYFKNTNKNKRNGTKLLLPIGLVADVKYGYNSTFEPLKINGEEREIALTGDELGELPYWLRPLSKRNSKKIKIDNLRSGDGRNETLYPYILTLQSEGLSKEEIKKTFNLINKYIFEDPLPVEELETITRDEAFNKKVFYVDGKFSPNLFGDYLISELNIKQINGQLHSYDDGVYVAGTKIIESKMLEILPSIRRSNRQEVLSYIDIKSLKNYSSQDANFIAFKNGVYNIKEKRLEPYTPNIIITNKIDYDYGPSAKCSLVD
>796458..797327
LactobacillussalivariusCECT5713MDKLACHQRDLVNLLYEIIAYTFYRRNELGKFFILTGSGANGKSTYLDMIRTLLGSKNISSLDVSELDQRFKTGELAGKLANIGDDISDSYIKDTSILKKLVTGEAVTAERKGLDPFMFENYSKLLFSANSIPRLGKGSDTKALNRRMVIVPFNATFSPKDPDYKPYIKYDLRQENAIKYLIVKSIEALHRILENNGFTKSELADRELEKYEYENNPILGFFDDLEETDYLNQPTKDVYKLYTEYCLRNGLNSVSNISFSRQITSHFNLTSKSSRVNGKVIRIYIKEEE
>797852..797922
GCGGGTATAAGTTAATGGCAGACAGTCAGATTCCCCAATCCGAAAGTGCGGGTTCAAGTCCCGTTATCGCT
>798185..798796
LactobacillussalivariusCECT5713MRIKLNPKIINWLEENVPGRPWKETFRMFKQEFPDLEWSLDSMKHSCYRRGIRNEIDSRYKKGHKSWCAGMKGLRIPGSEKGWFNEGRRPPNERPLGSERKYGKYTLVKVKRDGSKYEKWKPKQVHIWEQHNGPLPKGYIITFIDGDKSNLNIDNLACIKKSVNGAMNIKSLRSESPELFKVRVAQIELDQKIKKITKNLGSD
>798798..799745
LactobacillussalivariusCECT5713MGRRKKILFTDYFINLVDTYKLNQVGERTYNKYCLTHRHLKKICPDLYLQDMNANDYQQILNEFGKTHEKATTVDFHHQLAWALKRAYNVDGLTDRDVTYDAQIPKGVVTNKKKPKFMELDDMKKLVVTLKYLNSSYANFFLILLKTGLRFAELLGITLEDIDFEKKTISINKTLDYKKGAYDENFSRRFKSTKNKYSIRTIPVDDAVIYMFWRNAKGADKDESIFGSIKGFQYNSSLNNKLEQTCKYAGVPVITLHGLRHEHATYLVSQGIDSRAVAERLGHVDDSVTREVYIHRLETERVRDNQQIMRSVSKI
>800157..800810
LactobacillussalivariusCECT5713MKFDVKTVNKVLEIDDAFKAPTKMMNLMLDPKKREKTFKKFLEIETDMSYEWFQEYFGDEQAERKSKKQDFTPSSISNLVAQLVGKDKSTYYEPAAGTGSMLIAKWWNDRLKNPLYKRPETDNPLIKFLTSPTFTYDPRAYWYQAEELSNRAIPFLIFNMSIRGMNGSITQCDCLSRKATRAFFIRNDTPNYLGFSEVIELPKNQEVADLLGVHWDE
>806811..808508
LactobacillussalivariusCECT5713MLGWAYLDKPSPVVLTTYYAKMVVEGDIPAGKNIILACKRHLRDLERQGDEDFPWVFDEEKAHRPIRFIEKKCKPSKSVNAQLILQPWQHFIVGSMFGWVHRDTGLRRFREGVVFVGRKNGKTTLESGLADYMAGFDGERGANVYFLANAQVQARKLYDESKAMIEHSPYLAKRFVTTRSEIRFPKTNSTIVPMSVEKKNKDGENVHFAVFDEIHEYKDYFLISAMKQARGARLQPLIMYISTAGYVLDGPLMDFIDNGKEALSDYDAHVDERTFYYLASLDKVEESDDPELWIKANPNLCLMDTVNLISDYIKDKRTPAEYATWLTKQFNIFSSTDELSFVTIETINKNKRMIDEDTLLGRSCIGGYDLSETEDFTATGLEFKLDDGSIFWKMQSFVPEERVRIDKNPERLQEWEKQGYLTIVPGEYVNYEYVYNWFVEQAKKYKIQQINYDPNKALFLNQSLQQYGFNTKVVRQGFTTLGGPMQNMKELLLDGKVVTNNNLMFRWYLNNVKLVTDRNNNWMPTKQSRNRKIDGFAALLNAHESLWENLNVKEKKARIKFVSLR
>808521..809765
LactobacillussalivariusCECT5713MGFWNRIKSLITGNKKASGPVSLKTGNPFPISLSGSTLQTNETVFSVITQLSNAMASMPLKLYKNYEEVTDSDLAMEIKYHPNPSMTSFSFIQKLETDRNEYGNAYVLIERDEYWQPVNLYPISPTCVTVMQNQDDNSIWYKITATNENILVSEANILHLKHISGSTRLLGISPLDVLKNALDFDLAVQKFSLSEMSKVDSFKVTYGSNVDDESRKDVIDNFRAFIRDNGGVLFEEPGVEISQLPREFLSGDLINTEKITDTRIANAFNVPLAFLNQSTVSNNEDLMSQFVQRTLIPIARQYEQELTNKLLTEQQRKVGMYFKFNVNSLLRGNVQARTAYYQALRRSGILTTNDIRALEDLPLSKDEFADKLFVSGDLYPLDMDPAQRKGVSSNGNGIKTEETNQVLENEQNSR
>809746..810450
LactobacillussalivariusCECT5713MSKTQDNIGEISIYGEIVSEKWFDEEISATSFKDDLDDLGDVKTINLHINSPGGSVFEGIAIHNMLKMNKAKINVYVDGLAASIASVIAMSGDTIFMPENSMLMIHNPWTVAMGNSKELRKQADDLDRIAQASVKTYLSKSNGKIDEETLVKLLDEETWLSAQEAVDYGLADEVLESNKAVASLPGEFLERYKHVPNQLIKQSAPGNSINRERLIVKAKEKIDYVNNTLGGVTL
>810447..811577
LactobacillussalivariusCECT5713MTITLYEKKQNLGTLGSQLKKVNEEIAMKAGDPTVADKDLMQLQEQSESLEKRYNMLKEQVEREEAEQRAKFTKTKTPTMTAEEKLIHAKAEFYRGQKLSSDYKQVLGDDDSTTHGSKLLPVTIANDIIAEPTDTNPLRDDELVTAVTNLERPRIDVTIDDDSFVNDQEVAKEIGLKGDTVKFGRNKTKLKVAISEAILNGTDTNLVEHVNAQLQAGLARKEKKVAFAETAKPGEEEMSFYSTQNNIKKVSGSTLFDAITQAAGDIADEFQSDIKVYMTRPDYLKMIKELSNGAVSLFGKAPEEILGYPVRFTELAKKPVVGNFKYAQLNYEISSALYEQWKDYDKGVNNFQLTAWFDHKILLASAFRIADVVASK
>813237..813887
LactobacillussalivariusCECT5713MADNKFAIGTVGFNRILFGIMDGKEQVTKVVAIDSNSGGAVELKTSGFQGQSNTVYGSNIAYYVSDAGTGTGKVEITAVELPSDVATEVLGDKLDNGILETYSTVTQPYCAVIAEAEDLQGKKMWIGIAKAKFATVDADDLKTSEDKGKTSNNVSISGSAITRRSDKLVKAKGSETSGATFETFVAKMFPGFKAVDTITENAVTNPVLSPDGGSHQ
>814462..818286
LactobacillussalivariusCECT5713MAVGRPIGSMVVSLGLEAAKFTDGLKSIQNQFRLAKSEMRANMAELSSTGTAYEKASAKVDSLTKVMDVNQRKIESLRETYQNQVRTQGEYSNAAMRTASKINDAIRVQENYRRQLNDAKVAMNEAKRGTDSLRVSLETLQKTTTASITGLQAQGKTNEANLVKYRSLKEEVQQYNRILDDEKAKLKELVNVKGADARETQEQKVKVAELNAKVQQSQASYDSMNSKYKNMSTAQAVAKDSAEKLANQYKSVGNSVKDAGQKLTGFSTIAGLGLAAGLKTSISSLSEFKNTLNEIKNLAVTGGESVEEATRNVSRIQKDATQYSNQYGVSVNKIGDGYKELIKRGYTTNQALGAMKSELQASVASGDDFNDVVNVSSQVLEAFGMKVNSTSGMLKNTKTVTNELAYAADLTSTGFTDIGIGMSYVGSTAKTAKIELSETASAMGILSNNGLEADKAGTGLRQVINNLVTGVKNIDSKNSVLGKLGLKKKDLVDAQGNMKSLSAIFEAINSKMKGKESPEKASIFKSLFGTTGQQAGIILSQHVKELDELNKKVREAPKNNYVGALSAKNLQSAQNQMKIFKQSAANMGMSLAEVLLPPLSKVAASLSKFFQWVAQLPKPIKSTIAGVTLLAIAIGPLLIAVGSMITAIGAIKKVTTGISIAKKIKDIANSFKLLTILNPTTLGIGAVIALGAAFALAYQKIKPFREFINGIGKGIMNSLRPVINMVGTIGNSFKKLFNAMKTYFSENGLSFLHAFANVFKVVAIAIGASMSGIIVTIRVALNLIKNIFSTTWGSIEQIVGGVFTAIGGLLKVFAGLFTGNWQLLWSGVKDIFKGIWDSFKGIVGGVINIIIGIVNSGIDGINWLLDKFGAKQVKKLSPVKWATGTTRYYPNGLPETQLAMVNDGGKREAIVYPNGQVGMFKGMNVTTILPKGSHVINGDDTERLGLANYPDMHYYAKGTISFGSIWNGIKSGASKLWDDVSDGVKLAKNIVSHPIEALESAFSSSLKIGKSVQFAIDTAKGLGSFIIKNIKNGIVKEIKKWIDSNEDEGDSNSTSPKPTGSHKHWMEQAGIPKSWYEDLNWIINHESGWRVNATNPGSGAYGLPQSLPGNKMASAGKDWKTNPITQLKWMYSYVKGRYGNASNAKHFWQTHNWYANGGFVTQEQIAHIAEGNRPEAIIPLTNRTRAMQILAQVRDKYGLSAGNVVLSGDKQDNTDLSSLERKFDTVISLLGQIAGLSVEQVNALKAMKPSQSFDKNKFYQQMYKDQTINDYMNM
>826558..826580
ATAAAAAGGAGAGTACAGGATTT
Questionable (score 70-90)
Incomplete (score < 70)
Viewer Options
Click on a region in the genome above to show details here.
ORF Start: 778268
ORF Stop: 778290
Strand: Forward
Protein Sequence: ATAAAAAGGAGAGTACAGGATTT
Homolog/Ortholog Species: Attachment site
Homolog/Ortholog Protein: attL
Homolog/Ortholog E-Value: N/A
ORF Start: 791347
ORF Stop: 793056
Strand: Forward
Protein Sequence: MQLSYSRVSTFERNPLEYKLRYLEKLDTLPDFEPTDPLILGTAMHELIQKNQNAIQQYYMSYPLINDKHIEEAIKLELLSKKVLDLLPEYGFYEVTLSNQDYIGFIDMLVKNDDGTFDIYDFKYSNSIDNYMKSAQLHLYKYYFEQTGRKVKHLRYVFIPKIRLKQKKTESEYQFRQRLKRAINKDYQIKIKDVEYNPNKVIEWLTAAKHMSEATEFPLNEDDPFWKYSPYRDYVEKGLTYNMVTLPENKRRILTEVTRRKLWIYGAPFTGKTTFANEFPDPLMLNTDGNTSYVDAPVVPIKDEVTTTGRRTSRKFAWQVFKEYIDELEKKDNDFKTIVVDLVEDLYESCRLYMYDKLGIEHESDDPFKAWDEVRTEFLSTMRRVTNLDYENIVLISHEDSTKDILSRAGAKLTTFKPNIQEKVANKIAGMVDLVCRVVVEDNEHILSFKTTTTQFGGGRLSDLSVDSINLNYDELVDVYNTSLVDTNKPKKRKQTKIEDVDEEETQKAEIEDTEEKSKEEKPKTRKRKKREEPVEDPDVEKSAEDTEEKPKEEKPRRRRRRTRQVEED
Homolog/Ortholog Species: Hypothetical protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00650, hypothetical protein, phage(gi100041), PHAGE_Lactob_PLE2_NC_031036
Homolog/Ortholog E-Value: 5.47e-14
ORF Start: 793725
ORF Stop: 795422
Strand: Forward
Protein Sequence: MLIFYDYEVFKYDWLVVIKDPENKIETVIINDSEKLKKFHQEHENCIWVGYNNNHYDQWIHKSILCDINPYEISDMIINKGVPGWKASRLFRQIKMFNYDVMIRGDGGLKSLEGFMGSNIKESDVDFNIQRKLTQAEIDETIKYCRHDVEETMEVFLNRQSDFNAQLQLCKLPTQKMNLSYLSKSKAQMAGIILEARKKIYHDEFDLDFPDTLKIEKYAQVLDFYKNQENRDYSKSLKTEIAGVPHIYAWGGVHGAKPQYFGEGYFINMDVTSLYPSLMIQYGLLSRSIKDPRKFKEIYDTRVKYKHEGNPLQAPLKIVINSTYGAMKDKNNPLYDPRQANRVCIYGQLLLTDLIEKLEPYCEITQSNTDGVLVKLRSEDDFDLIDDIAWEWEKRTHLSLEFTEFKRVYQKDVNNYVMIGTDGHVKTKGAYVKKLNPLDNNLPILNTALVNYFVNNIPVEDTINDCDDLEQFQLIAKLSSKYKYLLLNGEILNERCVRAFASKKDTDGGLLKVHCVTGRPAKFPNSPEKCFIFNDNIKNVKAPEYLDKQWYIDMAKKRLKQFGVS
Homolog/Ortholog Species: Phage-like protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00651, DNA polymerase, phage(gi971746927), PHAGE_Entero_IME_EFm5_NC_028826
Homolog/Ortholog E-Value: 1.79e-73
ORF Start: 795423
ORF Stop: 796454
Strand: Forward
Protein Sequence: MKLYRGYVKSNEKGAIEKFKDVPDEKLRTLDNVKKFDSYGGILAEDIVMLDVDSIEDSDKLLDILDDLDYPCIARFTEHGVHFYFKNTNKNKRNGTKLLLPIGLVADVKYGYNSTFEPLKINGEEREIALTGDELGELPYWLRPLSKRNSKKIKIDNLRSGDGRNETLYPYILTLQSEGLSKEEIKKTFNLINKYIFEDPLPVEELETITRDEAFNKKVFYVDGKFSPNLFGDYLISELNIKQINGQLHSYDDGVYVAGTKIIESKMLEILPSIRRSNRQEVLSYIDIKSLKNYSSQDANFIAFKNGVYNIKEKRLEPYTPNIIITNKIDYDYGPSAKCSLVD
Homolog/Ortholog Species: Phage-like protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00652, gp32, phage(gi207270806), PHAGE_Lister_P40_NC_011308
Homolog/Ortholog E-Value: 1.30e-08
ORF Start: 796458
ORF Stop: 797327
Strand: Forward
Protein Sequence: MDKLACHQRDLVNLLYEIIAYTFYRRNELGKFFILTGSGANGKSTYLDMIRTLLGSKNISSLDVSELDQRFKTGELAGKLANIGDDISDSYIKDTSILKKLVTGEAVTAERKGLDPFMFENYSKLLFSANSIPRLGKGSDTKALNRRMVIVPFNATFSPKDPDYKPYIKYDLRQENAIKYLIVKSIEALHRILENNGFTKSELADRELEKYEYENNPILGFFDDLEETDYLNQPTKDVYKLYTEYCLRNGLNSVSNISFSRQITSHFNLTSKSSRVNGKVIRIYIKEEE
Homolog/Ortholog Species: Phage-like protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00653, DNA primase, phage(gi966201380), PHAGE_Strept_A25_NC_028697
Homolog/Ortholog E-Value: 5.65e-31
ORF Start: 797852
ORF Stop: 797922
Strand: Backward
Protein Sequence: AGISWQTVRFPNPKVRVQVPLSCT
Homolog/Ortholog Species: Trna
Homolog/Ortholog Protein: tRNA
Homolog/Ortholog E-Value: N/A
ORF Start: 798185
ORF Stop: 798796
Strand: Forward
Protein Sequence: MRIKLNPKIINWLEENVPGRPWKETFRMFKQEFPDLEWSLDSMKHSCYRRGIRNEIDSRYKKGHKSWCAGMKGLRIPGSEKGWFNEGRRPPNERPLGSERKYGKYTLVKVKRDGSKYEKWKPKQVHIWEQHNGPLPKGYIITFIDGDKSNLNIDNLACIKKSVNGAMNIKSLRSESPELFKVRVAQIELDQKIKKITKNLGSD
Homolog/Ortholog Species: Hypothetical protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00655, hypothetical protein, phage(gi31415769), PHAGE_Bacill_phBC6A51_NC_004820
Homolog/Ortholog E-Value: 9.87e-29
ORF Start: 798798
ORF Stop: 799745
Strand: Forward
Protein Sequence: MGRRKKILFTDYFINLVDTYKLNQVGERTYNKYCLTHRHLKKICPDLYLQDMNANDYQQILNEFGKTHEKATTVDFHHQLAWALKRAYNVDGLTDRDVTYDAQIPKGVVTNKKKPKFMELDDMKKLVVTLKYLNSSYANFFLILLKTGLRFAELLGITLEDIDFEKKTISINKTLDYKKGAYDENFSRRFKSTKNKYSIRTIPVDDAVIYMFWRNAKGADKDESIFGSIKGFQYNSSLNNKLEQTCKYAGVPVITLHGLRHEHATYLVSQGIDSRAVAERLGHVDDSVTREVYIHRLETERVRDNQQIMRSVSKI
Homolog/Ortholog Species: Integrase
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00656, integrase, phage(gi13095806), PHAGE_Lactoc_bIL309_NC_002668
Homolog/Ortholog E-Value: 1.50e-39
ORF Start: 800157
ORF Stop: 800810
Strand: Forward
Protein Sequence: MKFDVKTVNKVLEIDDAFKAPTKMMNLMLDPKKREKTFKKFLEIETDMSYEWFQEYFGDEQAERKSKKQDFTPSSISNLVAQLVGKDKSTYYEPAAGTGSMLIAKWWNDRLKNPLYKRPETDNPLIKFLTSPTFTYDPRAYWYQAEELSNRAIPFLIFNMSIRGMNGSITQCDCLSRKATRAFFIRNDTPNYLGFSEVIELPKNQEVADLLGVHWDE
Homolog/Ortholog Species: Phage-like protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00657, putative methyltransferase, phage(gi215401130), PHAGE_Staphy_Ipla35_NC_011612
Homolog/Ortholog E-Value: 8.66e-61
ORF Start: 806811
ORF Stop: 808508
Strand: Forward
Protein Sequence: MLGWAYLDKPSPVVLTTYYAKMVVEGDIPAGKNIILACKRHLRDLERQGDEDFPWVFDEEKAHRPIRFIEKKCKPSKSVNAQLILQPWQHFIVGSMFGWVHRDTGLRRFREGVVFVGRKNGKTTLESGLADYMAGFDGERGANVYFLANAQVQARKLYDESKAMIEHSPYLAKRFVTTRSEIRFPKTNSTIVPMSVEKKNKDGENVHFAVFDEIHEYKDYFLISAMKQARGARLQPLIMYISTAGYVLDGPLMDFIDNGKEALSDYDAHVDERTFYYLASLDKVEESDDPELWIKANPNLCLMDTVNLISDYIKDKRTPAEYATWLTKQFNIFSSTDELSFVTIETINKNKRMIDEDTLLGRSCIGGYDLSETEDFTATGLEFKLDDGSIFWKMQSFVPEERVRIDKNPERLQEWEKQGYLTIVPGEYVNYEYVYNWFVEQAKKYKIQQINYDPNKALFLNQSLQQYGFNTKVVRQGFTTLGGPMQNMKELLLDGKVVTNNNLMFRWYLNNVKLVTDRNNNWMPTKQSRNRKIDGFAALLNAHESLWENLNVKEKKARIKFVSLR
Homolog/Ortholog Species: Terminase
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00658, terminase large subunit, phage(gi526245012), PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865
Homolog/Ortholog E-Value: 0.0
ORF Start: 808521
ORF Stop: 809765
Strand: Forward
Protein Sequence: MGFWNRIKSLITGNKKASGPVSLKTGNPFPISLSGSTLQTNETVFSVITQLSNAMASMPLKLYKNYEEVTDSDLAMEIKYHPNPSMTSFSFIQKLETDRNEYGNAYVLIERDEYWQPVNLYPISPTCVTVMQNQDDNSIWYKITATNENILVSEANILHLKHISGSTRLLGISPLDVLKNALDFDLAVQKFSLSEMSKVDSFKVTYGSNVDDESRKDVIDNFRAFIRDNGGVLFEEPGVEISQLPREFLSGDLINTEKITDTRIANAFNVPLAFLNQSTVSNNEDLMSQFVQRTLIPIARQYEQELTNKLLTEQQRKVGMYFKFNVNSLLRGNVQARTAYYQALRRSGILTTNDIRALEDLPLSKDEFADKLFVSGDLYPLDMDPAQRKGVSSNGNGIKTEETNQVLENEQNSR
Homolog/Ortholog Species: Portal protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00659, portal protein, phage(gi526245013), PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865
Homolog/Ortholog E-Value: 2.16e-129
ORF Start: 809746
ORF Stop: 810450
Strand: Forward
Protein Sequence: MSKTQDNIGEISIYGEIVSEKWFDEEISATSFKDDLDDLGDVKTINLHINSPGGSVFEGIAIHNMLKMNKAKINVYVDGLAASIASVIAMSGDTIFMPENSMLMIHNPWTVAMGNSKELRKQADDLDRIAQASVKTYLSKSNGKIDEETLVKLLDEETWLSAQEAVDYGLADEVLESNKAVASLPGEFLERYKHVPNQLIKQSAPGNSINRERLIVKAKEKIDYVNNTLGGVTL
Homolog/Ortholog Species: Protease
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00660, Clp protease-like protein, phage(gi526245014), PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865
Homolog/Ortholog E-Value: 1.20e-90
ORF Start: 810447
ORF Stop: 811577
Strand: Forward
Protein Sequence: MTITLYEKKQNLGTLGSQLKKVNEEIAMKAGDPTVADKDLMQLQEQSESLEKRYNMLKEQVEREEAEQRAKFTKTKTPTMTAEEKLIHAKAEFYRGQKLSSDYKQVLGDDDSTTHGSKLLPVTIANDIIAEPTDTNPLRDDELVTAVTNLERPRIDVTIDDDSFVNDQEVAKEIGLKGDTVKFGRNKTKLKVAISEAILNGTDTNLVEHVNAQLQAGLARKEKKVAFAETAKPGEEEMSFYSTQNNIKKVSGSTLFDAITQAAGDIADEFQSDIKVYMTRPDYLKMIKELSNGAVSLFGKAPEEILGYPVRFTELAKKPVVGNFKYAQLNYEISSALYEQWKDYDKGVNNFQLTAWFDHKILLASAFRIADVVASK
Homolog/Ortholog Species: Head protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00661, major capsid protein, phage(gi526245015), PHAGE_Paenib_phiIBB_Pl23_NC_021865
Homolog/Ortholog E-Value: 2.99e-109
ORF Start: 813237
ORF Stop: 813887
Strand: Forward
Protein Sequence: MADNKFAIGTVGFNRILFGIMDGKEQVTKVVAIDSNSGGAVELKTSGFQGQSNTVYGSNIAYYVSDAGTGTGKVEITAVELPSDVATEVLGDKLDNGILETYSTVTQPYCAVIAEAEDLQGKKMWIGIAKAKFATVDADDLKTSEDKGKTSNNVSISGSAITRRSDKLVKAKGSETSGATFETFVAKMFPGFKAVDTITENAVTNPVLSPDGGSHQ
Homolog/Ortholog Species: Tail protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00662, major tail protein, phage(gi658607821), PHAGE_Lister_LP_101_NC_024387
Homolog/Ortholog E-Value: 3.36e-23
ORF Start: 814462
ORF Stop: 818286
Strand: Forward
Protein Sequence: MAVGRPIGSMVVSLGLEAAKFTDGLKSIQNQFRLAKSEMRANMAELSSTGTAYEKASAKVDSLTKVMDVNQRKIESLRETYQNQVRTQGEYSNAAMRTASKINDAIRVQENYRRQLNDAKVAMNEAKRGTDSLRVSLETLQKTTTASITGLQAQGKTNEANLVKYRSLKEEVQQYNRILDDEKAKLKELVNVKGADARETQEQKVKVAELNAKVQQSQASYDSMNSKYKNMSTAQAVAKDSAEKLANQYKSVGNSVKDAGQKLTGFSTIAGLGLAAGLKTSISSLSEFKNTLNEIKNLAVTGGESVEEATRNVSRIQKDATQYSNQYGVSVNKIGDGYKELIKRGYTTNQALGAMKSELQASVASGDDFNDVVNVSSQVLEAFGMKVNSTSGMLKNTKTVTNELAYAADLTSTGFTDIGIGMSYVGSTAKTAKIELSETASAMGILSNNGLEADKAGTGLRQVINNLVTGVKNIDSKNSVLGKLGLKKKDLVDAQGNMKSLSAIFEAINSKMKGKESPEKASIFKSLFGTTGQQAGIILSQHVKELDELNKKVREAPKNNYVGALSAKNLQSAQNQMKIFKQSAANMGMSLAEVLLPPLSKVAASLSKFFQWVAQLPKPIKSTIAGVTLLAIAIGPLLIAVGSMITAIGAIKKVTTGISIAKKIKDIANSFKLLTILNPTTLGIGAVIALGAAFALAYQKIKPFREFINGIGKGIMNSLRPVINMVGTIGNSFKKLFNAMKTYFSENGLSFLHAFANVFKVVAIAIGASMSGIIVTIRVALNLIKNIFSTTWGSIEQIVGGVFTAIGGLLKVFAGLFTGNWQLLWSGVKDIFKGIWDSFKGIVGGVINIIIGIVNSGIDGINWLLDKFGAKQVKKLSPVKWATGTTRYYPNGLPETQLAMVNDGGKREAIVYPNGQVGMFKGMNVTTILPKGSHVINGDDTERLGLANYPDMHYYAKGTISFGSIWNGIKSGASKLWDDVSDGVKLAKNIVSHPIEALESAFSSSLKIGKSVQFAIDTAKGLGSFIIKNIKNGIVKEIKKWIDSNEDEGDSNSTSPKPTGSHKHWMEQAGIPKSWYEDLNWIINHESGWRVNATNPGSGAYGLPQSLPGNKMASAGKDWKTNPITQLKWMYSYVKGRYGNASNAKHFWQTHNWYANGGFVTQEQIAHIAEGNRPEAIIPLTNRTRAMQILAQVRDKYGLSAGNVVLSGDKQDNTDLSSLERKFDTVISLLGQIAGLSVEQVNALKAMKPSQSFDKNKFYQQMYKDQTINDYMNM
Homolog/Ortholog Species: Tail protein
Homolog/Ortholog Protein: HN6_00663, putative tail protein, phage(gi937456768), PHAGE_Lactob_LBR48_NC_027990
Homolog/Ortholog E-Value: 8.86e-95
ORF Start: 826558
ORF Stop: 826580
Strand: Forward
Protein Sequence: ATAAAAAGGAGAGTACAGGATTT
Homolog/Ortholog Species: Attachment site
Homolog/Ortholog Protein: attR
Homolog/Ortholog E-Value: N/A
Terminase
Portal Protein
Coat Protein
Tail Shaft
Integrase
Phage-like Protein
Other
Transposase
Plate Protein
tRNA
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